La Editorial Bonaventuriana se creó el 7 de marzo de 2012, y más propiamente, la Coordinación Editorial de la seccional Medellín se creó el 20 de febrero de 2013. La Editorial Bonaventuriana está conformada por coordinaciones editoriales adscritas a las Vicerrectorías Académicas de Bogotá, Medellín, Cali y Cartagena. A través de sus correspondientes Coordinadores Editoriales, se enlazan de manera directa con el editor general. Cada Coordinación cuenta con un Comité Editorial encargado de velar por las buenas prácticas editoriales y dar cumplimiento a las políticas.